La Sociedad Cultural y Educativa Ambato fue creada en 1976 por un grupo de ambateños encabezado por el Sr. José Cuesta Holguín como Presidente, con el fin de promover actividades culturales y educativas en la ciudad de Ambato, a través de un Centro Educativo que brinde un importante servicio a favor de la juventud ambateña y de todo el país. Desde entonces la Institución se ha dedicado a formar a niños y jóvenes brindando los mejores servicios educativos con personal altamente calificado.  En ese mismo año se  inician las labores educativas como “Centro Educativo Atenas” en las instalaciones del Colegio Pío X, donde funcionó hasta 1985.

En 1981 se adquiere el terreno en el sector de Yacupamba, parroquia Izamba; con capitales propios de la Sociedad Cultural y Educativa Ambato y gracias al apoyo de la Sra. Maruja Holguín de Cuesta, para destinarlo a la construcción de las instalaciones del Centro Educativo Atenas donde funciona hasta la actualidad.  Cinco años después se inaugura la primera etapa de la construcción y para el año 1987 se finaliza la segunda etapa que incluye  talleres de arte, salón  de uso múltiple y  canchas deportivas.

En 1989 se obtiene la aprobación ministerial para el funcionamiento del nivel secundario y se coloca la primera piedra para la edificación de su infraestructura.  En 1992 se da inicio al ciclo diversificado con tres especializaciones Ciencias Físico Matemáticas, Ciencias Contables y Ciencias Sociales, con la incorporación de la primera promoción de 36 bachilleres en 1996.

En 1997 el Centro Educativo Atenas  pasa a formar parte del proyecto de Reforma Curricular del Bachillerato según  Acuerdo Ministerial 1382 con el aval de la Universidad Andina Simón Bolívar.

En el año 2005 la institución es reconocida legalmente como fundación, cambiando su denominación a Fundación Cultural y Educativa Ambato.  Desde ese momento,  a pedido del señor José Filometor Cuesta Holguín, asume  la presidencia el  Lcdo. José Filometor Cuesta Vásconez. En el mismo año, se realiza la primera Planificación Estratégica para definir la proyección institucional al 2015.

En el año 2006, el Centro Educativo Atenas se convierte en la primera institución educativa del centro del país en alcanzar la Certificación Internacional de Calidad ISO 9001.  En el 2007 pasa a ser considerada como unidad educativa según acuerdo ministerial

En el año 2008, la Fundación Cultural y Educativa Ambato inaugura el Centro “Llave del Aprendizaje”, que cuenta con un equipo de profesionales entregados a ayudar a personas con dislexia, mediante el Programa Davis® para la Correcciòn de la Dislexia, ofreciendo soluciones para mejorar no sólo en el aspecto escolar y profesional, sino también el ámbito emocional y familiar.

En junio de 2009, se incorpora a la institución, en calidad de Director Ejecutivo y Representante Legal de la Fundación Cultural y Educativa Ambato, el ingeniero Ramiro Castro Chiriboga, profesional con 37 años de trayectoria administrando empresas del sector público y privado, lo que garantiza continuidad y la ejecución de procesos de mejoramiento continuo en todas las áreas.

En el año 2010 la Fundación Cultural y Educativa Ambato, abre el centro de capacitación profesional CLIC (Computing and International Certifications) que fundamenta su actividad en dos áreas de capacitación: programas de Certificación Internacional en Computación y la enseñanza de idiomas.